W 2006 roku Rutkowski skoczył najdalej podczas pierwszej serii. Wylądował na 111. metrze. Wyprzedzał go jedynie Gregor Schlierenzauer. Austriak uzyskał 109 m, ale otrzymał lepsze oceny za styl. W drugiej rundzie reprezentant Polski miał dziewiąty wynik i ostatecznie sklasyfikowano go na czwartej pozycji.
Dwa lata później młodszy brat Mateusza Rutkowskiego ponownie nie utrzymał pozycji w czołowej trójce. W Zakopanem doleciał do 94. metra, co okazało się najlepszą odległością. Przy tak dalekim skoku trudno było o dobre lądowanie. Polak ustał, ale dostał od sędziów 4 noty po 16,5 punktu i jedną piętnastkę. W drugiej rundzie uzyskał ósmy rezultat i znowu zakończył rywalizację tuż za podium. W 2006 r. miał 1,6 punktu straty do brązowego medalisty, a dwa lata później - 5 pkt. W Zakopanem reprezentacja Polski z Rutkowskim w składzie zajęła trzecie miejsce w konkursie drużynowym.
