W połowie 2013 roku Bayern Monachium pozyskał na zasadzie wolnego transferu Jana Kirchhoffa z FSV Mainz. Mierzący 195 centymetrów piłkarz nie zyskał uznania w oczach Pepa Guardioli i w styczniu 2014 roku trafił na wypożyczenie do Schalke 04 Gelsenkirchen.
[ad=rectangle]
Dorobek Kirchhoffa w zespole z Veltins-Arena jest bardzo skromny: 15 meczów i brak goli oraz asyst. Zawodnik długo zmagał się z kontuzją, a po powrocie do zdrowia nie zachwycił, choć w końcówce rundy jesiennej zdołał wywalczyć miejsce w wyjściowej "11" ekipy Roberto Di Matteo.
Schalke zapewniło sobie możliwość wykupienia defensywnego pomocnika, który może grać także w linii obrony, w 2015 roku za 6 mln euro. - Poinformowaliśmy już Bayern, że nie skorzystamy z tej możliwości - wyznał dyrektor sportowy Horst Heldt, przesądzając powrót Kirchhoffa na Allianz Arena.
Wszystko wskazuje na to, że dla zawodnika nie znajdzie się miejsce w zespole Guardioli w przyszłym sezonie. Bayern zapewne spróbuje sprzedać Kirchhoffa choćby za niewielką sumę, biorąc pod uwagę, iż jego kontrakt wygasa 30 czerwca 2016 roku.