W 1999 roku Claudio Pizarro trafił do Werderu Brema z Allianza Lima, by po dwóch sezonach przenieść się do Bayernu Monachium (2001-2007). W 2008 roku Werder pozyskał najskuteczniejszego obcokrajowca w historii Bundesligi z Chelsea Londyn, a po czterech latach Pizarro znów przeniósł się do Bayernu.
Przed zakończeniem zawodowej kariery Pizarro ponownie będzie występował w klubie z Weserstadion. Odkąd stało się jasne, że jego umowa z mistrzem Niemiec nie zostanie przedłużona, niespełna 37-letni snajper podkreślał, iż pragnie pozostać za naszą zachodnią granicą. Brał nawet pod uwagę oferty z 2. Bundesligi, ale priorytetowo zawsze traktował Werder.
W zespole Viktora Skripnika Peruwiańczyk najprawdopodobniej będzie pełnił rolę rezerwowego napastnika. W podstawowym składzie występują znacznie bardziej perspektywiczni Anthony Ujah oraz Aron Johannsson.
Pizarro dla Bayernu rozegrał 327 spotkań i zdobył 125 goli. Jego statystyki w Werderze to odpowiednio 220 meczów oraz 127 bramek.