Jan Zapotoka został zakupiony przez Lecha 13 sierpnia 2009 roku, podczas pobytu w Poznaniu wystąpił w czternastu ligowych spotkaniach. W tym sezonie kibice Kolejorza mogli go zobaczyć raz na boiskach ekstraklasy podczas pojedynku z Górnikiem Zabrze w X kolejce. Większą część rundy jesiennej spędził on w zespole Młodej Ekstraklasie, gdzie rozegrał osiem spotkań.
Słowacki pomocnik został wypożyczony do FK ZTS Dubnica, czyli tego samego klubu, z którego został on wykupiony przez Lecha. Zapotoka będzie starał się pomóc ostatniemu zespołowi ligi słowackiej.
