ŁKS 18. maja podobnie jak cztery inne kluby ekstraklasy: Piast Gliwice, Cracovia Kraków, Arka Gdynia i Polonia Warszawa dowiedział się, że Komisja Licencyjna nie wyraziła zgody na jego występy w najwyższej klasie rozgrywkowej. Powodem takiej, a nie innej decyzji były zastrzeżenia do infrastruktury stadionowej i problemy finansowe klubu.
Do 26. maja włodarze ŁKS-u mieli czas na odwołanie się od postanowienia komisji. Uzupełniona dokumentacja wpłynęła do siedziby PZPN we właściwym terminie. Dwa dni później Komisja Odwoławcza zdecydowała się odrzucić wniosek zespołu z Łodzi i nie przyznała mu licencji. Tym samym ŁKS nie zagra w przyszłym sezonie rozgrywek ekstraklasy.
W szeregach klubu nie kryją zaskoczenia czwartkową decyzją. - Zarząd Klubu jest szczerze zaskoczony decyzją PZPN o nieprzyznaniu ŁKS S.S.A. licencji na grę w ekstraklasie w sezonie 2009/2010.Decyzję tę uznajemy za błędną i krzywdzącą. Komisja licencyjna nie podała szczegółów uzasadnienia swojej decyzji, prócz zdawkowego stwierdzenia, że jej powodem jest "sytuacja finansowa Klubu". Jest to niezrozumiałe tym bardziej, że po raz pierwszy od dawna sytuacja finansowa ŁKS S.S.A. wyraźnie się poprawiła. Nie możemy zgodzić się z tak niesprawiedliwym potraktowaniem Naszego Klubu. Skoro więc decyzję tę traktujemy jako pozbawioną podstaw merytorycznych, jest zrozumiałe, że dołożymy wszelkich możliwych, dozwolonych prawnie starań by ją zmienić. Niezwłocznie po usłyszeniu tej szokującej decyzji poleciłem naszym prawnikom podjecie stosownych działań prawnych - czytamy w oficjalnym komunikacie prezesa Romana Gałuszki.
ŁKS Łódź na kolejkę przed końcem sezonu zajmuje jedenaste miejsce w tabeli i może być praktycznie pewny utrzymania.