Przed sezonem 2004/05 Europejska Unia Piłkarska dokonała zmiany w regulaminie rozgrywek Pucharu UEFA. Kluby, które przebrnęły przez pierwszą rundę, kwalifikowały się do pięciozespołowych grup, w której mecze odbywały się systemem "każdy z każdym", ale bez rewanżów. Każda z drużyn rozgrywała dwa mecze na własnym boisku i dwa na wyjeździe. Trzy najlepsze zespoły awansowały do kolejnego etapu, rozgrywanego już systemem play off - mecz i rewanż.
Do tej pory polskie zespoły występowały w fazie grupowej Pucharu UEFA trzykrotnie. Jesienią 2004 roku udało się tego dokonać Amice Wronki, która w pierwszej rundzie wyeliminowała łotewski FK Ventspils (1:1 na wyjeździe i 1:0 we Wronkach). Dla wronieckiego zespołu stracie z piłkarską Europą było bolesną lekcją. Amica przegrała wszystkie cztery spotkania i to wysoko - z Glasgow Rangers 0:5 (dom), Grazer AK 1:3 (wyjazd), AZ Alkmaar 1:3 (dom) i AJ Auxerre 1:5 (wyjazd).
Dwa lata później w rozgrywkach grupowych Pucharu UEFA zagrała Wisła Kraków, która w decydującym spotkaniu wyeliminowała Iraklis Saloniki (0:1 u siebie i 2:0 po dogrywce na wyjeździe). Piłkarze "Białej Gwiazdy" spisali się lepiej niż Amica, ale zdołali wygrać tylko jedno spotkanie - w Krakowie z FC Basel 3:1. Porażki z Blackburn Rovers 1:2 (dom), AS Nancy 1:2 (wyjazd) i z Feyenoordem Rotterdam 1:3 (wyjazd) sprawiły, że krakowianie uplasowali się na czwartej pozycji w grupie.
W sezonie 2008/09 po dramatycznych bojach z Austrią Wiedeń (1:2 w Wiedniu i 4:2 po dogrywce w Poznaniu) do fazy grupowej dotarł Lech Poznań. Kolejorz rywalizację rozpoczął od remisu na własnym stadionie AS Nancy 2:2. Po wyjazdowej porażce z CSKA Moskwa 1:2 i remisie w Poznaniu z Deportivo La Coruna 1:1, lechici w ostatnim spotkaniu pokonali w Rotterdamie Feyenoord 1:0 i awansowali do trzeciej rundy rozgrywek. W niej nie sprostali Udinese Calcio (2:2 u siebie i 1:2 na wyjeździe).
W 2009 roku UEFA zmieniła nazwę i system rozgrywek - Puchar UEFA zastąpiła Liga Europejska. Zwiększyła się też liczba zespołów uczestniczących w fazie grupowej z 40 do 48. Stawka uczestników podzielona została na 12 czterozespołowych grup, w których rywalizacja toczy się systemem "każdy z każdy" - mecz i rewanż. Zamiast czterech, drużyny rozgrywają po sześć spotkań. Po dwie najlepsze ekipy z każdej grupy uzyskują awans do kolejnej rundy LE.
Lechici blisko zakwalifikowania się do rozgrywek grupowych LE już byli przed rokiem, ale w decydującym spotkaniu przegrali z FC Brugge po rzutach karnych 3:4.
W obecnym sezonie mistrzowie Polski rywalizację w europejskich pucharach zaczynali od rund kwalifikacyjnych Ligi Mistrzów. Po wyeliminowaniu po rzutach karnych Inter Baku, dwukrotnie ulegli Sparcie Praga po 0:1 i zostali przeniesieni do czwartej rundy kwalifikacyjnej LE. W walce o awans do rozgrywek grupowych okazali się lepsi od Dnipro Dniepropietrowsk, wygrywając na wyjeździe 1:0 i remisując w Poznaniu 0:0.
W piątek w Monako odbędzie się losowanie fazy grupowej LE. Pierwsze mecze rozegrane zostaną 16 września, a rywalizacja w grupach zakończy się 15-16 grudnia.